蛋白质组学技术在炎症中的应用和前景-国家食用菌中心发表综述成果

  河南大学国家食用菌加工技术研发专业中心博士研究生王森业(第一作者)、康文艺(通讯作者)、陈晓宇(通讯作者)在期刊《Food Science and Human Wellness》(中科院1TopIF=5.6)上发表题为“Application and prospects of proteomic technology in inflammation: a review”的综述

蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,在整体水平上大规模、高通量、系统性地分析蛋白质组中的蛋白特性、表达量及功能的动态变化等,阐明机体效应活动或功能的过程。随着高通量蛋白质组分析技术的发展,蛋白质组学技术已广泛应用于生物学、医学、药学、农学、植物学等领域,逐渐成为推动科学进步的重要力量。本文综述了近年来蛋白质组学在炎症领域的应用,特别是在治疗靶点和作用机制方面的研究进展,为更有效地预防、诊断和治疗炎症开辟了一条新途径,为人类生命健康提供医疗保障。

图1 蛋白质组学应用

通过对细胞蛋白质组的分析,研究人员可以识别参与炎症反应的差异表达蛋白和途径。这些蛋白质和途径可以作为诊断和监测炎症性疾病的潜在生物标志物。常见的生物标志物有白介素(IL)类、趋化因子(CCL)类、抗原分化簇CD)、干扰素诱导蛋白(IFITs)等。常见的靶点有热休克蛋白(HSP)家族(HSP60HSP90)、鸟苷酸结合蛋白(GBP)家族(GBP1GBP2GBP4)、干扰素激活基因(IFI)蛋白家族(IFIH1IFI202IFI204)caspase蛋白家族(CASP6CASP8)、趋化因子(CCL3CCL4CCL9)、趋化因子(C-X-C基序)配体蛋白家族(CXCL1CXCL2CXCL8)、基质金属蛋白酶蛋白家族(MMP1MMP9)S100A蛋白家族(S100A8S100A9)参与炎症反应的调控,这些蛋白可以作为靶向药物开发的新靶点。此外,参与炎症调控的信号通路主要涉及Toll-like receptor signaling pathwayMAPK signaling pathwayNF-κB signaling pathwayIFN/JAK-STAT signaling pathwayTNF signaling pathwayRIG-I like receptor signaling pathway等。详见全文链接


图2 NF-κB / MAPK / JAK/STAT 信号通路

图3  RIG-I like receptors /TNF 信号通路

蛋白质组学的研究得益于基因组学和转录组学的研究,也离不开蛋白分离鉴定技术及生物信息学的更新与发展。只有蛋白质组学与其他组学技术相互促进和渗透,才进一步揭示生命现象的活动本质和规律,为人类的生命健康保驾护航。

参考文献:

Senye Wang, Yanhai Chu, Jiajia Yuan, Yiqi Li, Zhenhua Liu, Xiaoyu Chen, Wenyi Kang,Application and prospects of proteomic technology in inflammation: a review,Food Science and Human Wellness,Volume 13, Issue 5,2024, 2373-2385.

原文链接:

https://doi.org/10.26599/FSHW.2022.9250248